2,3,4,6-เตตระฟลูออโรเบนซิล แอลกอฮอล์ ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร สารประกอบนี้มีคุณค่าในการนำกลุ่มเบนซิลฟลูออรีนเข้าไปในโมเลกุลเป้าหมาย โครงสร้างฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรและ bioavailability ของผลิตภัณฑ์สุดท้าย นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาสารเคมีเฉพาะทาง โดยเฉพาะในการผลิตผลึกเหลวและวัสดุขั้นสูง รวมถึงเป็นบล็อกก่อสร้างในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์หรือโครงสร้างเฉพาะ