ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรและเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายากำจัดวัชพืชและยาฆ่าเชื้อรา โครงสร้างฟลูออรีนช่วยเพิ่ม bioavailability และความเสถียรทางเมแทบอลิซึมในสารออกฤทธิ์ ใช้บ่อยในสูตรป้องกันพืชเนื่องจากความตอบสนองและความสามารถในการซึมผ่านเนื้อเยื่อพืชอย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในเคมีเภสัชเพื่อสร้างสารประกอบเฮเทโรไซคลิกฟลูออรีนที่มีคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ที่ดีขึ้น