ใช้เป็นสารตั้งต้นหลักในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรและเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนาอนุพันธ์ซัลฟาไมด์และไทโอยูเรียที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ หมู่ไอโซธิโอไซยาเนตทำปฏิกิริยาได้ง่ายกับเอมีนและแอลกอฮอล์ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อนสำหรับสารป้องกันศัตรูพืชและสารประกอบทางการแพทย์ นอกจากนี้ ยังใช้ในการเตรียมชิ้นส่วนก่อสร้างฟลูออรีน โดยที่หมู่ทริฟลูออโรเมทิลซัลฟานิลช่วยเพิ่มลิโพฟิลิกและความเสถียรทางเมแทบอลิซึม