ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตรที่มีฟลูออรีน เนื่องจากโครงสร้างอะโรมาติกที่ได้รับการปรับแต่งสูง การมีอะตอมฟลูออรีนหลายตัวช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมทางชีวภาพในสารออกฤทธิ์ มักใช้ในการเตรียมสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดเชื้อรา โดยการแทนที่ด้วยฟลูออรีนช่วยปรับปรุงการทะลุผ่านเยื่อไขมันและการจับกับเป้าหมาย นอกจากนี้ยังใช้ในเคมีเภสัชกรรมในการพัฒนายับยั้ง kinase และยาต้านการอักเสบ โดยใช้ผลกระทบดึงอิเล็กตรอนของฟลูออรีนเพื่อปรับความตอบสนองและประสิทธิภาพ หมู่เอสเตอร์และคาร์บอนิลช่วยให้สามารถดัดแปลงเพิ่มเติมได้ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลฟลูออรีนที่ซับซ้อน