ใช้เป็นตัวกลางในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการผลิตสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าเชื้อรา หมู่ trifluoromethyl ช่วยเพิ่มความเสถียรและ bioavailability ของสารออกฤทธิ์สุดท้าย ทำให้มีประสิทธิภาพสูงขึ้นต่อศัตรูพืชเป้าหมาย นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนายาเภสัชภัณฑ์ที่สารประกอบฟลูออรีนมีค่าด้วยความต้านทานต่อการเผาผลาญและ lipophilicity ที่เพิ่มขึ้น ใช้ทั่วไปในงานวิจัยสำหรับการสร้างโมเลกุลฟลูออรีนที่ซับซ้อนเนื่องจากกลุ่มฟังก์ชันที่ทำปฏิกิริยาได้