ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาอนุพันธ์ฟลูออรีนของโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โครงสร้างของมันช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ ทำให้มีคุณค่าในการเคมียาเพื่อปรับปรุงยาที่มีศักยภาพ ใช้บ่อยในการออกแบบยาสำหรับระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) และตัวยับยั้งเอนไซม์ เนื่องจากผลกระทบของอะตอมฟลูออรีนต่อความสัมพันธ์ในการจับและเภสัชจลนศาสตร์ โดยเฉพาะในกลุ่มยากดประสาทและยานิ่งใจ ช่วยเพิ่มประสิทธิภาพการจับกับตัวรับในระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ยังถูกนำมาใช้ในการวิจัยพัฒนายาใหม่ที่มีเป้าหมายไปที่ช่องไอออนหรือเอนไซม์เฉพาะ ซึ่งเกี่ยวข้องกับโรคทางระบบประสาท เช่น โรคซึมเศร้า วิตกกังวล และโรคลมชัก รวมถึงการวิจัยเกษตรเคมีสำหรับพัฒนายาฆ่าแมลงใหม่ที่มีประสิทธิภาพดีขึ้นและโปรไฟล์สิ่งแวดล้อมที่ดีขึ้น