4-Fluoro-7-nitrobenzofurazan ใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารสำหรับติดฉลากเรืองแสงในงานวิจัยทางชีวเคมี ช่วยในการตรวจจับและวัดปริมาณโมเลกุลชีวภาพต่างๆ การประยุกต์ใช้มีความสำคัญในการศึกษากิจกรรมของเอนไซม์และปฏิกิริยาของโปรตีน เนื่องจากมีความไวสูงและเสถียรภายใต้สภาวะที่แตกต่างกัน นอกจากนี้ ยังใช้เป็นสาร derivatization ในโครมาโทกราฟีเพื่อเพิ่มการตรวจจับกรดอะมิโนและสารประกอบอื่นๆ ความสามารถในการสร้าง adducts เรืองแสงที่เสถียรทำให้มีคุณค่าในเคมีวิเคราะห์สำหรับการวิเคราะห์ร่องรอยและใน bioassays สำหรับการตรวจสอบกระบวนการเซลล์แบบเรียลไทม์