ใช้ PicoGreen ในการตรวจสอบและวัดปริมาณดีเอ็นเอในตัวอย่างชีวภาพ โดยเฉพาะดีเอ็นเอที่มีความเข้มข้นต่ำมาก เช่น ตัวอย่างจากเซลล์แยกเฉพาะ หรือตัวอย่างที่ผ่านกระบวนการสกัดแล้ว มีความไวสูงกว่าวิธีการย้อมสีแบบเดิม เช่น Hoechst หรือ Ethidium Bromide ทำให้สามารถตรวจจับดีเอ็นเอได้ในระดับพิโคกรัมต่อมิลลิลิตร นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการวิจัยทางชีววิทยาโมเลกุล เช่น การตรวจสอบประสิทธิภาพการสกัดดีเอ็นเอ การเตรียมตัวอย่างสำหรับการถัดลำดับดีเอ็นเอ (NGS) หรือการวิเคราะห์ปริมาณเซลล์จากตัวอย่างสิ่งแวดล้อม เนื่องจาก PicoGreen จะเรืองแสงเมื่อจับกับดีเอ็นเอคู่สาย (double-stranded DNA) จึงให้ผลลัพธ์ที่เฉพาะเจาะจงและแม่นยำ สามารถใช้ร่วมกับเครื่องอ่านพลาต (plate reader) ที่ตรวจจับการเรืองแสง ทำให้เหมาะกับการวิเคราะห์จำนวนมากในเวลาเดียวกัน (high-throughput screening) และลดความผิดพลาดจากปัจจัยภายนอก