ใช้ Calcein AM เป็นตัวติดฉลากเซลล์ที่มีชีวิตในการทดลองทางชีววิทยา โดยเฉพาะในการตรวจสอบความมีชีวิตของเซลล์ (viability assay) เนื่องจากมันสามารถซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ได้ เมื่อเข้าสู่ภายในเซลล์ เอนไซม์เอสเตอเรสจะทำลายกลุ่ม AM (acetoxymethyl ester) ออก ทำให้เกิด Calcein ที่มีประจุลบและติดอยู่ภายในเซลล์ ซึ่งจะเรืองแสงสีเขียวเมื่อถูกกระตุ้นด้วยแสงยูวีหรือแสงสีน้ำเงิน การเรืองแสงนี้ใช้ตรวจสอบเซลล์ที่ยังมีชีวิตอยู่ภายใต้กล้องจุลทรรศน์หรือเครื่องอ่านค่าฟลูออเรสเซนซ์ โดยเซลล์ที่ตายแล้วมักไม่สามารถรักษา Calcein ไว้ได้หรือขาดเอนไซม์ที่จำเป็น จึงไม่เรืองแสง นอกจากนี้ Calcein AM ยังใช้ในงานศึกษาการไหลของแคลเซียมในเซลล์ การติดตามการถ่ายโอนเซลล์ หรือการประเมินประสิทธิภาพของสารที่มีผลต่อเซลล์ เช่น ยาต้านมะเร็งหรือสารพิษ