2-ฟลูออโรฟลูออรีน ถูกใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาและการวิจัยทางเภสัชกรรม เนื่องจากมีหมู่ฟลูออรีนที่ช่วยเพิ่มความเสถียรและปรับปรุงคุณสมบัติทางชีวภาพของโมเลกุล สารนี้จึงนิยมใช้ในการพัฒนายาที่ต้องการความสามารถในการดูดซึมสูงและระยะเวลาออกฤทธิ์ยาวนาน นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในงานวัสดุศาสตร์ เช่น การผลิตสารเรืองแสงหรือวัสดุอินทรีย์สำหรับอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์ เช่น OLED โดยช่วยปรับระดับพลังงานของอิเล็กตรอนในโมเลกุลให้เหมาะสมกับการใช้งาน