สารละลายแมงกานีสใช้ในหลายด้าน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมการเกษตรเพื่อเสริมธาตุอาหารในพืช เพราะแมงกานีสมีบทบาทสำคัญในการสังเคราะห์แสงและการสร้างเอนไซม์บางชนิด พืชที่ขาดแมงกานีสอาจแสดงอาการใบเหลืองระหว่างเส้นใบ จึงนิยมใช้สารละลายแมงกานีสพ่นทางใบหรือผสมกับปุ๋ยน้ำ นอกจากนี้ ยังใช้ในอุตสาหกรรมเคมีเป็นตัวเร่งปฏิกิริยา หรือเป็นสารตั้งต้นในการผลิตสารประกอบแมงกานีสอื่น ๆ เช่น แมงกานีสไดออกไซด์ ที่ใช้ในแบตเตอรี่แห้ง หรือในกระบวนการบำบัดน้ำเสียเพื่อลดปริมาณสารพิษ ในอุตสาหกรรมวัสดุ สารละลายแมงกานีสใช้เคลือบผิวโลหะเพื่อเพิ่มความต้านทานการกัดกร่อน และใช้ในกระบวนการผลิตเหล็กกล้าเพื่อควบคุมคุณสมบัติของโลหะผสมให้มีความแข็งแรงและทนต่อแรงกระแทกมากขึ้น