ใช้ในการทดสอบวินิจฉัยสำหรับความผิดปกติของการเผาผลาญ โดยเฉพาะอย่างยิ่ง ethylmalonic encephalopathy ซึ่งเป็นภาวะทางพันธุกรรมที่หายาก ระดับที่สูงของ ethylmalonic acid ในของเหลวในร่างกาย เช่น ปัสสาวะหรือเลือด เป็นตัวบ่งชี้ทางชีวภาพสำหรับการออกซิเดชันกรดไขมันไมโตคอนเดรียที่บกพร่องและการเผาผลาญกรดอินทรีย์ ช่วยให้แพทย์ระบุข้อบกพร่องในกิจกรรมของ short-chain acyl-CoA dehydrogenase (SCAD) นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเพื่อศึกษาความผิดปกติของไมโตคอนเดรียและความเครียดออกซิเดชันในโมเดลเซลล์ การสะสมของสารนี้เกี่ยวข้องกับอาการทางระบบประสาท ทำให้มีความสำคัญในงานศึกษาทางประสาทเคมี