แอมโมเนียมไบฟลูออไรด์ถูกใช้อย่างแพร่หลายในแอปพลิเคชันอุตสาหกรรมต่างๆ เนื่องจากคุณสมบัติที่เป็นเอกลักษณ์ของมัน มักใช้ในการกัดกร่อนและการสร้างพื้นผิวขุ่นบนกระจก เพื่อสร้างลวดลายตกแต่งหรือใช้งานบนพื้นผิวแก้ว ในอุตสาหกรรมโลหะ ทำหน้าที่เป็นสารทำความสะอาดเพื่อขจัดออกไซด์และสิ่งปนเปื้อนจากพื้นผิวโลหะ โดยเฉพาะในการบำบัดอะลูมิเนียมและสแตนเลสสตีล ยังใช้ในการผลิตเซรามิกและเป็นส่วนประกอบในผลิตภัณฑ์ทำความสะอาดอุปกรณ์อุตสาหกรรม นอกจากนี้ มีบทบาทในอุตสาหกรรมปิโตรเลียมในฐานะตัวเร่งปฏิกิริยาในการกลั่นน้ำมัน ความสามารถในการทำปฏิกิริยากับซิลิกาทำให้มีประโยชน์ในการผลิตอิเล็กทรอนิกส์และเซมิคอนดักเตอร์สำหรับการกัดกร่อนเวเฟอร์ซิลิคอน อย่างไรก็ตาม เนื่องจากมีคุณสมบัติกัดกร่อน จึงต้องจัดการอย่างระมัดระวังและใช้มาตรการความปลอดภัยที่เหมาะสม