เมทิล 4-ไอโอโดบิวทาโนเอท ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการเตรียมโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น ทำหน้าที่เป็นสารกลางในการผลิตเภสัชภัณฑ์ โดยสามารถนำมาใช้ในการนำกลุ่มบิวทาโนเอทเข้าไปในสารประกอบเป้าหมาย อะตอมไอโอดีนในโมเลกุลทำให้เป็นสารตั้งต้นที่มีคุณค่าในการทำปฏิกิริยาคัปปลิงต่างๆ เช่น Suzuki หรือ Sonogashira couplings ซึ่งช่วยในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์เคมีภัณฑ์ละเอียดและสารเคมีเกษตร โดยความสามารถในการทำปฏิกิริยาของมันช่วยในการสร้างผลิตภัณฑ์ที่ฟังก์ชันนาไลซ์หลากหลาย กลุ่มเอสเทอร์ของมันยังทำให้เป็นสารตั้งต้นที่มีประโยชน์ในการสังเคราะห์เอสเทอร์ กรด และแอลกอฮอล์ผ่านปฏิกิริยาการไฮโดรไลซิสหรือรีดักชัน