ซิส-ไดเมทิล ไซโคลเฮกเซน-1,2-ไดคาร์บ็อกซิเลต ใช้หลักly เป็นสารกลางในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตสารเคมีเฉพาะทางและเภสัชภัณฑ์ เป็นส่วนประกอบหลักในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน เนื่องจากมีวงแหวนไซโคลเฮกเซนที่เสถียรและกลุ่มคาร์บ็อกซิเลต ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ใช้ในการสังเคราะห์ส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) และยาตัวสมัคร โดยเฉพาะยาที่ต้องการโครงสร้างวงแหวนที่แข็ง นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาพอลิเมอร์และสารเคลือบผิว ซึ่งโครงสร้างของมันช่วยเพิ่มความทนทานและความต้านทานต่อสารเคมี บทบาทในการสังเคราะห์แบบอะซิมเมตริกยังทำให้มีคุณค่าในการผลิตสารคีเรลที่ใช้ในอุตสาหกรรมความแม่นยำสูงต่างๆ