ใช้ในสังเคราะห์อินทรีย์เป็นตัวป้องกันหมู่ไฮดรอกซี (protecting group) โดยเฉพาะในขั้นตอนการสร้างสารประกอบที่มีความซับซ้อน เช่น การสังเคราะห์สารธรรมชาติหรือยา หมู่ tert-butyldimethylsilyl (TBS) มีความเสถียรต่อสภาวะเบสและบางสภาวะกรดอ่อน ทำให้สามารถคุ้มครองหมู่ -OH ระหว่างปฏิกิริยาอื่นๆ ได้อย่างมีประสิทธิภาพ และสามารถถอดกลุ่มป้องกันออกได้ภายหลังโดยใช้สารตัวทำละลายฟลูออไรด์ เช่น TBAF โดยไม่ทำลายโครงสร้างหลักของโมเลกุล