ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการพัฒนาโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพซึ่งมีคุณสมบัติต้านเชื้อรา หรือกำจัดวัชพืช โครงสร้างฟลูออรีนของมันช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ ทำให้มีคุณค่ามากในเคมียาสำหรับการปรับปรุงสารนำทาง นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อนำเสนอหมู่ฟังก์ชัน difluoromethyl ester ซึ่งสามารถปรับเปลี่ยนเพิ่มเติมเพื่อสร้างโมเลกุลซับซ้อน