ใช้เป็นสารกลางในสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมเภสัชภัณฑ์และเคมีภัณฑ์ละเอียด หมู่ฟังก์ชัน—ไฮดรอกซิลและเอสเตอร์—ช่วยให้เกิดการแปลงเฉพาะเจาะจง เช่น การออกซิเดชัน การรีดักชัน และการเอสเตริฟิเคชัน ใช้กันทั่วไปในการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพ รวมถึงสเตียรอยด์และโปรสตาแกลนดิน เนื่องจากโครงสร้างวงและความยืดหยุ่นทางสเตอริโอเคมี นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์น้ำหอมและรสชาติ โดยที่อนุพันธ์ไซโคลเฮกซีนมีส่วนช่วยในคุณสมบัติทางกลิ่นที่ต้องการ โปรไฟล์ปฏิกิริยาของมันทำให้เหมาะสำหรับปฏิกิริยาเปิดวงและการแอนนูเลชันในการสร้างโมเลกุลซับซ้อน