ใช้เป็นตัวกลางในการสังเคราะห์เภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพและยาตัวสมัคร แหวนไซโคลบิวเทนที่ตึงเครียดและสารย่อยฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและมีผลต่อลิโพฟิลิก ทำให้มีคุณค่าต่อเคมียารักษาเพื่อปรับปรุงคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ กลุ่มเอสเตอร์เบนซิลช่วยปกป้องกรดคาร์บอกซิลิกในระหว่างการแปลงสังเคราะห์และสามารถกำจัดออกได้อย่างเลือกเฉพาะภายใต้สภาวะอ่อนโยน นิยมใช้ในการเตรียมตัวยับยั้งโปรติเอส อะโกนิสต์รีเซพเตอร์ และการบำบัดแบบกำหนดเป้าหมายอื่นๆ โดยที่การฟลูออรีนช่วยปรับปรุงความสัมพันธ์การจับและความต้านทานต่อการย่อยสลายออกซิเดชัน รวมถึงงานวิจัยด้านยาต้านไวรัส ยาต้านมะเร็ง และสารปรับภูมิคุ้มกัน เนื่องจากโครงสร้างช่วยให้แทรกซึมเข้าสู่เซลล์ได้ดีและมีความเข้ากันได้ทางชีวภาพสูง