ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเกษตรเคมี อะตอมไอโอดีนทำหน้าที่เป็นหมู่ที่ออกง่าย (leaving group) ซึ่งช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น Suzuki หรือ Stille cross-couplings หมู่เอสเตอร์สามารถถูกไฮโดรไลซิสเป็นกรดคาร์บอกซิลิกที่สอดคล้องกัน หรือถูกรีดิวซ์เป็นแอลกอฮอล์ ซึ่งช่วยให้สามารถปรับแต่งโครงสร้างเพิ่มเติมได้ ใช้กันทั่วไปในการเตรียมสารประกอบเฮเทโรไซคลิกและโมเลกุลชีวภาพที่ต้องการตัวคั่นห้าคาร์บอนพร้อมจุดปฏิกิริยาตามปลาย หมู่เอสเทอร์เทอร์ต-บิวทิลให้ความเสถียรภายใต้สภาวะปฏิกิริยาต่างๆ และสามารถถูกถอดการป้องกัน (deprotected) ภายใต้สภาวะกรดเมื่อจำเป็น