ใช้เป็นสารตั้งต้นหลักในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมสารประกอบทางเภสัชกรรม โครงสร้างของมันช่วยให้เกิดการแปลงเฉพาะเจาะจงได้เนื่องจากมีกลุ่มฟังก์ชันที่ถูกปกปิด ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน ใช้กันทั่วไปในการออกแบบโพรดรัก (prodrug) ซึ่งกลุ่มอะซีทอกซีสามารถถูกตัดด้วยเอนไซม์ในร่างกายเพื่อปลดปล่อยเมตาโบไลต์ที่ออกฤทธิ์ นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนายาต้านไวรัสและยาต้านมะเร็ง โดยโมติฟไซโคลโพรเพนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมตาบอลิซึมและการชีวเภสัชจลนศาสตร์ เหมาะสำหรับปฏิกิริยาเอสเทอร์การ์และการไฮโดรไลซิสภายใต้สภาวะควบคุม ซึ่งช่วยให้รวมเข้ากับโครงสร้างโมเลกุลที่ใหญ่กว่าได้