ใช้หลักๆ เป็นตัวทำละลายพิเศษและสารกลางในการสังเคราะห์อินทรีย์ สารประกอบนี้ถูกนำไปใช้ในการเตรียมยาและสารเคมีเกษตร สายโซ่แอลคิลฟลูออรีนของมันช่วยเพิ่มความละลายในลิพิด ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพที่มีการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ที่ดีขึ้น นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์อนุพันธ์ฟลูออรีนสำหรับการศึกษาการเผาผลาญ โดยอะตอมฟลูออรีนทำหน้าที่เป็นตัวติดตามหรือตัวปรับความเสถียร เนื่องจากมีหน้าที่เอสเตอร์ มันสามารถเกิดการไฮโดรไลซิสหรือทรานส์เอสเทอร์ฟิเคชันเพื่อนำหมู่ฟลูออรีนเข้าไปในโครงสร้างโมเลกุลที่ใหญ่กว่า การใช้ในน้ำหอมหรือรสชาติมีจำกัด แต่บทบาทหลักยังคงอยู่ในงานวิจัยและพัฒนาภายในเคมียารักษาโรค