ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในงานสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมโมเลกุลชีวภาพและยา หมู่ไอโอดีนช่วยให้สามารถแปลงโครงสร้างเพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น ปฏิกิริยา Suzuki หรือ Stille ซึ่งช่วยในการสร้างโครงสร้างอินทรีย์ที่ซับซ้อน หมู่เอสเตอร์สามารถถูกไฮโดรไลซ์หรือรีดิวซ์ได้ง่าย ทำให้มีความยืดหยุ่นในการปรับเปลี่ยนโมเลกุลสำหรับใช้ในการพัฒนายาและโพลิเมอร์ที่ถูกฟังก์ชันนาไลซ์ นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์โพรบและสารที่มีฉลากสำหรับการศึกษาไบโอเคมี เนื่องจากมีอะตอมไอโอดีนหนักซึ่งช่วยในการตรวจจับหรือใช้เป็นจุดสำหรับการติดฉลากรังสี