เอทิล (5-ไอโอโดเพนทอกซี)อะซิเตท ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางสำหรับการเตรียมโมเลกุลซับซ้อนต่างๆ โครงสร้างของมันซึ่งมีทั้งกลุ่มเอสเทอร์และกลุ่มไอโอโดอัลคิล ทำให้มีความยืดหยุ่นในการสร้างกรอบเคมีที่ซับซ้อนยิ่งขึ้น มักถูกนำมาใช้ในการพัฒนายา โดยสามารถเป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีพิเศษ รวมถึงสารลดแรงตึงผิวและโพลิเมอร์ ซึ่งกลุ่มปฏิกิริยาของมันช่วยให้สามารถปรับแต่งเพิ่มเติมได้ สารนี้ยังถูกใช้ในงานวิจัยเพื่อศึกษากลไกปฏิกิริยาและพัฒนาวิธีการสังเคราะห์ใหม่ๆ