(R)-(−)-เอพิคลอโรไฮดริน ใช้หลักในการสังเคราะห์สารประกอบคิรัลและยา การประยุกต์ใช้มีความสำคัญในการผลิตยาที่บริสุทธิ์แบบเอ็นแอนติโอเมอร์ โดยที่สเตอรีโอเคมีเฉพาะของโมเลกุลจำเป็นต่อกิจกรรมทางชีวภาพ ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตเบต้า-บล็อกเกอร์ ซึ่งสำคัญในการรักษาโรคหัวใจและหลอดเลือด นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมเรซินเอพ็อกซี ซึ่งนำไปใช้ในเคลือบผิว กาว และวัสดุคอมโพสิต ให้ประสิทธิภาพและความทนทานที่เพิ่มขึ้น สารเคมีนี้ยังใช้ในการพัฒนาวัสดุขั้นสูง เช่น เรซินแลกเปลี่ยนไอออนและสารเคมีบำบัดน้ำ เนื่องจากความตอบสนองทางเคมีและความสามารถในการสร้างโพลิเมอร์ที่เสถียร