ฟอสโฟกลูโคมิวเทสเป็นเอนไซม์ที่มีบทบาทสำคัญในกระบวนการเมแทบอลิซึมของคาร์โบไฮเดรต โดยเฉพาะในเส้นทางการสลายน้ำตาลกลูโคส (glycolysis) และการสังเคราะห์ไกลโคเจน (glycogenesis) เอนไซม์นี้ช่วยในการเปลี่ยนกลูโคส-1-ฟอสเฟตให้เป็นกลูโคส-6-ฟอสเฟต ซึ่งเป็นขั้นตอนสำคัญที่เชื่อมโยงระหว่างการสลายน้ำตาลและการสังเคราะห์ไกลโคเจน ในทางคลินิก การศึกษาฟอสโฟกลูโคมิวเทสมีความสำคัญในการทำความเข้าใจโรคทางเมแทบอลิซึม เช่น โรคสะสมไกลโคเจน (glycogen storage diseases) นอกจากนี้ ยังมีการนำเอนไซม์นี้ไปใช้ในงานวิจัยทางชีวเคมีและเทคโนโลยีชีวภาพ เพื่อพัฒนากระบวนการผลิตสารชีวโมเลกุลและยารักษาโรค