ไพรูเวตดีคาร์บอกซิเลสจากยีสต์เบเกอร์ (S. cerevisiae) ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในการผลิตเอทานอลผ่านกระบวนการหมัก มันมีบทบาทสำคัญในการแปลงไพรูเวตเป็นอะเซตัลดีไฮด์ ซึ่งจากนั้นถูกย่อให้เป็นเอทานอล ทำให้จำเป็นในอุตสาหกรรมการกลั่นและพลังงานชีวภาพ เอนไซม์นี้ยังถูกใช้ในงานวิจัยทางชีวเคมีเพื่อศึกษากลไกการเผาผลาญ โดยเฉพาะที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญคาร์โบไฮเดรต นอกจากนี้ มันยังเป็นเอนไซม์โมเดลสำหรับการศึกษาปฏิกิริยาที่ขึ้นกับไทอามีนไดฟอสเฟต ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับกลไกเอนไซม์และการเร่งปฏิกิริยา การประยุกต์ใช้ยังขยายไปถึงการสังเคราะห์สารประกอบคีรัลในเคมีอินทรีย์ ซึ่งช่วยในการผลิตสารบริสุทธิ์ทางเอนานติโอเมอร์