ไรโบนิวคลีเอส A ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีววิทยาโมเลกุลเนื่องจากความสามารถในการย่อยสลาย RNA โดยทั่วไปใช้ในการกำจัด RNA ออกจากตัวอย่าง DNA ระหว่างการทำให้บริสุทธิ์กรดนิวคลีอิก เพื่อให้ได้ DNA คุณภาพสูงสำหรับการใช้งานต่อเนื่อง เช่น PCR หรือการถอดรหัสลำดับ ในงานศึกษโปรตีน มันทำหน้าที่เป็นเอนไซม์ตัวอย่างสำหรับการทำความเข้าใจการพับตัวของโปรตีน ความเสถียร และกลไกการทำงานของเอนไซม์ เนื่องจากมีโครงสร้างและหน้าที่ที่ได้รับการศึกษาอย่างละเอียด นอกจากนี้ ไรโบนิวคลีเอส A ยังถูกใช้ในเซลล์เพาะเลี้ยงเพื่อป้องกันการปนเปื้อนของ RNA ซึ่งช่วยรักษาความสมบูรณ์ของผลการทดลอง ความจำเพาะสำหรับ RNA วงเดี่ยวทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการศึกษาการเผาผลาญและโครงสร้างของ RNA