โฮโมซิสทีนเมทิลทรานสเฟอเรสมีบทบาทสำคัญในการเมแทบอลิซึมของกรดอะมิโนที่มีกำมะถัน โดยเฉพาะในการแปลงโฮโมซิสทีนเป็นเมธิโอนีนโดยใช้ตัวถ่ายเมทิลกรุ๊ป กิจกรรมของเอนไซม์นี้จำเป็นสำหรับการรักษาระดับโฮโมซิสทีนให้ต่ำในร่างกาย เนื่องจากโฮโมซิสทีนสูงเกี่ยวข้องกับโรคหัวใจและหลอดเลือด ความผิดปกติทางระบบประสาท และปัญหาการพัฒนา เอนไซม์นี้สนับสนุนกระบวนการเมทิลเลชันที่จำเป็นสำหรับการสังเคราะห์ ซ่อมแซม และการควบคุม epigenetic ของดีเอ็นเอ ในสถานการณ์ทางคลินิกและการวิจัย มันถูกศึกษาเพื่อศักยภาพในการวินิจฉัยและรักษาความผิดปกติทางเมแทบอลิซึม เช่น โฮโมซิสตินิurea นอกจากนี้ ยังใช้ในงานทดลองชีวเคมีเพื่อตรวจสอบการทำงานของวัฏจักรเมธิโอนีนและประเมินสถานะวิตามินบี12และโฟเลต ซึ่งเป็นโคแฟคเตอร์ในปฏิกิริยา กิจกรรมของมันยังเกี่ยวข้องกับวิทยาศาสตร์โภชนาการและการพัฒนากลยุทธ์การรักษาสำหรับลดภาวะโฮโมซิสตินีเมียสูง นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการสร้างเอส-อะดีโนซิลเมทิโอนีน (SAMe) ซึ่งเป็นสารตั้งต้นที่จำเป็นสำหรับปฏิกิริยาเมทิลเลชันในเซลล์ และมีความสำคัญต่อการทำงานของดีเอ็นเอ โปรตีน และสารสื่อประสาท