ใช้ในชีววิทยาโมเลกุลสำหรับการทำ dephosphorylation ของ DNA และ RNA เพื่อป้องกันการ ligation ตัวเองระหว่างการโคลนมิ่ง โดยทั่วไปใช้ใน restriction enzyme cloning และการเตรียมเวกเตอร์ นอกจากนี้ยังใช้ใน diagnostic assays เพื่อตรวจจับการแสดงออกของยีน และใน clinical tests เพื่อวัดความผิดปกติของตับและกระดูกเนื่องจากมีอยู่ในเซรั่ม

ใช้ในห้องปฏิบัติการทางชีววิทยาในการตรวจวัดกิจกรรมของยีน เนื่องจากสามารถติดฉลาก DNA หรือ RNA แล้วตรวจสอบได้ผ่านปฏิกิริยาที่ให้สีหรือแสงเรือง luminescence ช่วยในการวิเคราะห์การถ่ายทอดทางพันธุกรรมและงานวิจัยทางโมเลกุล รวมถึงการตรวจจับโปรตีนใน western blotting เมื่อใช้เป็น enzyme-linked antibody label

ใช้ในทางการแพทย์เพื่อประเมินภาวะสุขภาพ โดยเฉพาะการตรวจสอบการทำงานของตับและกระดูก เนื่องจากระดับของเอนไซม์นี้ในเลือดจะสูงขึ้นในกรณีที่มีโรคตับ ภาวะกระดูกผิดปกติ หรือโรคฮอร์โมนบางชนิด

ในอุตสาหกรรมชีวภาพ ใช้ในการทำ dephosphorylation ของ DNA เพื่อป้องกันการ ligate ตัวเองในขั้นตอนการสร้างเวกเตอร์ทางพันธุกรรม ซึ่งเป็นขั้นตอนสำคัญในการตัดต่อยีน รวมถึงการใช้งานใน biosensors และ bioremediation processes