ใช้ในทางการแพทย์เป็นหลัก โดยเฉพาะในการรักษาโรคมะเร็งเม็ดเลือดขาวชนิดเฉียบพลันลิมโฟบลาสติก (Acute Lymphoblastic Leukemia: ALL) ซึ่งพบบ่อยในเด็ก เป็นส่วนหนึ่งของเคมีบำบัดแบบรวมกับยาอื่นๆ ในระยะเริ่มต้นและระยะรวมพลัง เอ็นไซม์นี้ทำงานโดยการสลายกรดอะมิโนแอสพารากีน (Asparagine) ในเลือด เซลล์มะเร็งไม่สามารถผลิตแอสพารากีนได้เองและต้องพึ่งพาจากภายนอก การลดระดับแอสพารากีนจึงยับยั้งการเจริญเติบโตและการแพร่กระจายของเซลล์มะเร็งเหล่านี้ ทำให้เซลล์มะเร็งตายลง ยังใช้ในบางกรณีของมะเร็งต่อมน้ำเหลือง (Lymphoma) อีกด้วย

นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมอาหารเพื่อลดการเกิดอะคริลาไมด์ในอาหารประเภทแป้งที่ปรุงด้วยความร้อนสูง เช่น ชิปส์และเฟรนช์ฟรายส์ ซึ่งช่วยลดระดับสารก่อมะเร็งที่อาจเกิดขึ้น

มีการศึกษาวิจัยเพิ่มเติมสำหรับการใช้ในโรคอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องกับการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกัน หรือภาวะผิดปกติของการเมแทบอลิซึมกรดอะมิโน