L-Propargylglycine methyl ester hydrochloride ถูกใช้หลักในการวิจัยทางชีวเคมีในฐานะตัวยับยั้งเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับการเผาผลาญกรดอะมิโน โดยมีประสิทธิภาพสูงในการศึกษาฟังก์ชันของเอนไซม์ เช่น cystathionine gamma-lyase (CSE) และ cystathionine beta-synthase (CBS) ซึ่งมีบทบาทสำคัญในเส้นทาง transsulfuration การยับยั้งเอนไซม์เหล่านี้ช่วยให้นักวิจัยสามารถตรวจสอบบทบาททางสรีรวิทยาและพยาธิสรีรวิทยาของ hydrogen sulfide (H₂S) และสารประกอบที่มีกำมะถันอื่นๆ ในกระบวนการทางชีวภาพต่างๆ รวมถึงการอักเสบ ฟังก์ชันหัวใจและหลอดเลือด และการป้องกันทางประสาทนอกจากนี้ สารประกอบนี้ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์อนุพันธ์และอนุโลมสำหรับการศึกษาทางเภสัชวิทยาต่อไป ซึ่งช่วยในการพัฒนายา therapeutic ที่มีศักยภาพโดยมุ่งเป้าไปที่เส้นทางเมแทบอลิซึมที่เกี่ยวข้อง