Tris-HEPES Native Running Buffer ใช้ในการวิเคราะห์โปรตีนด้วยเทคนิค electrophoresis โดยเฉพาะการแยกโปรตีนในสภาวะที่ไม่มีการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างธรรมชาติ (native condition) ช่วยให้สามารถศึกษาโปรตีนในรูปแบบที่ใกล้เคียงกับสภาพในเซลล์มากที่สุด บัฟเฟอร์นี้มีความเสถียรและช่วยรักษาค่า pH ที่เหมาะสมระหว่างกระบวนการวิเคราะห์ ทำให้ได้ผลลัพธ์ที่แม่นยำและชัดเจน นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษาการทำงานและปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนในสภาวะธรรมชาติ โดยไม่รบกวนโครงสร้างหรือหน้าที่ของโปรตีน