2,6-Difluoro-4-nitroaniline เป็นสารเคมีที่ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอื่นๆ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมผลิตสีย้อมและสารเคมีทางการเกษตร เนื่องจากโครงสร้างที่มีกลุ่มฟลูออรีนและไนโตรเจน ซึ่งช่วยเพิ่มความเสถียรและปฏิกิริยาของสาร นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในการวิจัยและพัฒนายา โดยเป็นส่วนหนึ่งของกระบวนการสร้างโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านจุลชีพหรือยาต้านมะเร็ง เนื่องจากคุณสมบัติทางเคมีที่เหมาะสมสำหรับการปรับเปลี่ยนโครงสร้างให้มีประสิทธิภาพสูงขึ้น