3-Methoxybenzhydrylamine เป็นสารประกอบที่นำมาใช้หลักในการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในงานวิจัยเภสัชกรรม สารนี้ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตสารชีวภาพต่างๆ รวมถึงผู้สมัครยาที่มีศักยภาพ โครงสร้างของมันมักถูกนำมาใช้ในการพัฒนาโมเลกุลที่เล็งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาท เนื่องจากความสามารถในการโต้ตอบกับตัวรับเฉพาะในสมอง นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการเตรียมลิแกนด์สำหรับกระบวนการเร่งปฏิกิริยาในเคมีอินทรีย์ ซึ่งช่วยในการสร้างตัวเร่งปฏิกิริยาที่มีประสิทธิภาพและเลือกสรรได้มากขึ้น ความหลากหลายของมันทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าในเคมียารักษาและการประยุกต์ใช้วัสดุศาสตร์