ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์เป็นหน่วยย่อยไดเปปไทด์ที่ถูกป้องกัน กลุ่ม tert-butoxycarbonyl (Boc) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันอะมีน ช่วยให้สามารถกำจัดแบบเลือกสรรและเชื่อมต่อในขั้นตอนการประกอบเปปไทด์แบบ stepwise เอสเตอร์เบนซิลทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันคาร์บอกซิล ซึ่งสามารถกำจัดได้ภายใต้สภาวะอ่อนโยน เช่น hydrogenolysis โดยไม่กระทบต่อกลุ่มฟังก์ชันอื่นที่อ่อนไหว สารนี้มีประโยชน์โดยเฉพาะในการเตรียมเปปไทด์ซับซ้อนและ peptidomimetics สำหรับงานวิจัยเภสัชกรรม รวมถึงตัวยับยั้งเอนไซม์และการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพที่มีกิจกรรม ความเสถียรและปฏิกิริยาเลือกสรรทำให้มีคุณค่าในสังเคราะห์เปปไทด์แบบ solid-phase และ solution-phase