Fmoc-Gly-Pro-OH เป็นสารเคมีที่ใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในการใช้เป็นหน่วยสร้าง (building block) ในวิธี Fmoc solid-phase peptide synthesis (SPPS) เนื่องจากกลุ่ม Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกัน (protecting group) สำหรับหมู่อะมิโน ซึ่งสามารถกำจัดออกได้ง่ายโดยใช้เบส เช่น ไพเปอริดีน ทำให้สามารถควบคุมการเติบโตของสายเปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ Fmoc-Gly-Pro-OH ยังถูกนำมาใช้ในการศึกษาโครงสร้างและหน้าที่ของเปปไทด์และโปรตีน เนื่องจากไกลซีน (Gly) และโพรลีน (Pro) เป็นกรดอะมิโนที่พบได้บ่อยในโครงสร้างของโปรตีน และมักเกี่ยวข้องกับการสร้างโครงสร้างทุติยภูมิ เช่น เบต้า-ชีท (β-sheet) และเกลียวอัลฟา (α-helix) จึงเป็นประโยชน์ในการพัฒนายาและสารชีวโมเลกุลที่มีความจำเพาะและประสิทธิภาพสูง