4-Chloro-5-fluoro-2-(n-propyl-d7)-pyrimidine ถูกนำมาใช้ในการวิจัยและพัฒนายา โดยเฉพาะในด้านการสร้างโมเลกุลสำหรับการศึกษาทางเภสัชวิทยาและเมแทบอลิซึม เนื่องจากมีไอโซโทปดิวเทอเรียม (deuterium) ในโครงสร้าง ทำให้สามารถติดตามและวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงของสารในร่างกายได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบอื่นๆ ที่มีความสำคัญทางการแพทย์ เช่น ยาต้านไวรัสหรือยาต้านมะเร็ง เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและลดผลข้างเคียงของยา