2-Chloro-4-(methyl-d3)-5-cyclopropylpyrimidine เป็นสารเคมีที่ใช้หลักในการวิจัยและพัฒนายาเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลยาที่มีเดยูเทอเรียม (deuterated drug molecules) ซึ่งมีความสำคัญเพิ่มขึ้นในการศึกษาการเมแทบอลิซึมของยาและเภสัชจลนศาสตร์ การนำอะตอมเดยูเทอเรียม เช่น ในสารนี้ มาประกอบโครงสร้างสามารถเพิ่มความเสถียรและประสิทธิภาพของยาเภสัชกรรมโดยชะลอการย่อยสลายทางเมแทบอลิซึม ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างยาที่มีประสิทธิภาพสูงขึ้นและคงอยู่นานขึ้น นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาสารเคมีเกษตร โดยโครงสร้างของสารนี้ช่วยในการสร้างยาฆ่าแมลงหรือสารกำจัดวัชพืชชนิดใหม่ที่มีประสิทธิภาพดีขึ้นและผลกระทบต่อสิ่งแวดล้อมลดลง ส่วนประกอบ cyclopropyl และ pyrimidine ยังทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีประโยชน์ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน