(4,6-bis(methyl-d3)pyridin-3-yl)boronic acid ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมี โดยเฉพาะในปฏิกิริยาคุปปลิง (Suzuki coupling) ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่สำคัญในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบบอโรนิกเอซิดกับสารประกอบอะริลหรือวินิลฮาไลด์ สารเคมีนี้มักใช้เป็นสารตั้งต้นในการผลิตสารประกอบอินทรีย์ที่ซับซ้อน เช่น ยา สารเคมีสำหรับการวิจัยทางชีววิทยา และวัสดุอิเล็กทรอนิกส์ เนื่องจากโครงสร้างที่มีกลุ่มเมทิลที่ติดฉลากด้วยดิวเทอเรียม (methyl-d3) ทำให้สารนี้มีประโยชน์ในการศึกษาเกี่ยวกับกลไกปฏิกิริยาและการติดตามไอโซโทปในกระบวนการทางเคมีและชีวเคมี นอกจากนี้ ยังอาจถูกนำไปใช้ในการพัฒนายาเพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพและความเสถียรของโมเลกุลยา