ใช้ในงานวิจัยทางเภสัชกรรมเป็นมาตรฐานภายใน (internal standard) สำหรับการวิเคราะห์สาร clotrimazole โดยใช้เทคนิคโครมาโตกราฟีร่วมกับแมสสเปกโตรเมตรี (LC-MS/MS) เพื่อให้การวัดปริมาณสารตั้งต้นในตัวอย่างชีวภาพ เช่น พลาสมาหรือเลือด มีความแม่นยำและเชื่อถือได้มากขึ้น เนื่องจาก clotrimazole-d5 มีคุณสมบัติทางเคมีคล้ายคลึงกับสารต้นแบบ แต่สามารถแยกแยะได้โดยเครื่องมือวิเคราะห์ จึงช่วยชดเชยการสูญเสียในขั้นตอนการเตรียมตัวอย่างและลดความคลาดเคลื่อนในการวัดค่า