ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมและชีวเคมีเป็นตัวติดตามหรือตัวทำเครื่องหมายไอโซโทป โดยเฉพาะในการศึกษาเส้นทางการเผาผลาญของสารประกอบที่มีโครงสร้างเบนซีน การแทนที่ด้วยหมู่เมทอกซีที่มีดิวเทอเรียม (D3) ช่วยให้สามารถติดตามการเปลี่ยนแปลงของโมเลกุลได้อย่างแม่นยำผ่านเทคนิคการวิเคราะห์เช่น mass spectrometry หรือ NMR นิยมใช้ในงานพัฒนายาเพื่อศึกษาพฤติกรรมของสารออกฤทธิ์ในร่างกาย โดยไม่เปลี่ยนแปลงคุณสมบัติทางเคมีมากนักแต่เพิ่มความแม่นยำในการวัดผล