ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชวิทยาและชีวเคมีเป็นตัวติดตามหรือตัวทำเครื่องหมายเพื่อศึกษาการดูดซึม การกระจายตัว การเปลี่ยนแปลงทางชีวภาพ และการขับออกของมีสคาลีนในระบบชีวภาพ เนื่องจากมีการแทนที่ด้วยดีเทอเรียม (deuterium) ทำให้สามารถติดตามได้อย่างแม่นยำด้วยเทคนิคสเปกโตรเมตรีมวล (mass spectrometry) นิยมใช้ในงานพัฒนายาหรือศึกษาโมเดลทางชีวภาพที่เกี่ยวข้องกับสารจิตประดิษฐ์และสารออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง