9-Anthryldiazomethane ถูกใช้เป็นหลักในฐานะสารทำเครื่องหมาย (derivatization agent) ในเคมีวิเคราะห์ โดยเฉพาะสำหรับการตรวจจับและวัดปริมาณกรดคาร์บอกซิลิก สารนี้ทำปฏิกิริยากับกรดคาร์บอกซิลิกเพื่อก่อให้เกิดอนุพันธ์ที่เสถียรและเรืองแสง (fluorescent) ซึ่งสามารถวิเคราะห์ได้ง่ายโดยใช้โครมาโทกราฟีของเหลวประสิทธิภาพสูง (HPLC) ร่วมกับการตรวจจับแบบเรืองแสง การประยุกต์ใช้นี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการวิเคราะห์กรดไขมัน กรดอะมิโน และกรดอินทรีย์อื่นๆ ในตัวอย่างชีวภาพที่ซับซ้อน เช่น เลือด ปัสสาวะ และเนื้อเยื่อ ความไวและความจำเพาะสูงทำให้เป็นเครื่องมือที่มีประโยชน์ในเมแทบอลอมิกส์ การวินิจฉัยทางคลินิก และการวิเคราะห์สิ่งแวดล้อม นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในการศึกษาการเผาผลาญลิพิดและการระบุตัวบ่งชี้ทางชีวภาพในโรคต่างๆ