4-Sulfophenyl isothiocyanate sodium salt monohydrate ใช้เป็นสาร derivatizing agent ในเคมีวิเคราะห์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับการติดฉลากกรดอะมิโน เปปไทด์ และโปรตีน สารนี้ช่วยในการตรวจจับและวัดปริมาณ biomolecules เหล่านี้ในตัวอย่างต่างๆ ผ่านเทคนิคเช่น HPLC และ mass spectrometry กลุ่ม isothiocyanate ของมันทำปฏิกิริยากับ primary amines สร้าง thiourea derivatives ที่เสถียร ซึ่งจำเป็นสำหรับการวิเคราะห์ที่แม่นยำในงานวิจัยชีวเคมีและการวินิจฉัย นอกจากนี้ ยังใช้ในการศึกษากโครงสร้างและหน้าที่ของโปรตีน ช่วยในการระบุลำดับกรดอะมิโนและการดัดแปลงหลังการแปล น้ำละลายได้ดีเนื่องจากกลุ่ม sulfophenyl ทำให้เหมาะสมสำหรับขั้นตอนวิเคราะห์ในระบบน้ำ