เมทิล β-L-ฟูโคไพแรโนไซด์ ใช้หลักในการวิจัยทางชีวเคมีในฐานะอนุพันธ์คาร์โบไฮเดรตเฉพาะทาง เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการศึกษากระบวนการไกลโคซิลเลชันและกลไกของเอนไซม์ โดยเฉพาะที่เกี่ยวข้องกับฟูโคซิเดสและฟูโคซิลทรานสเฟอเรส สารประกอบนี้มักใช้เป็นซับสเตรตหรือตัวยับยั้งในงานทดสอบเอนไซม์เพื่อตรวจสอบความจำเพาะและกิจกรรมของเอนไซม์เหล่านี้ นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการสังเคราะห์โอลิโกซักคาไรด์และไกลโคคอนจูเกตที่ซับซ้อน ซึ่งจำเป็นสำหรับการทำความเข้าใจการโต้ตอบระหว่างเซลล์และเส้นทางสัญญาณ การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการพัฒนายารักษาที่มีพื้นฐานจากไกลโคไบโอโลจี โดยช่วยในการออกแบบยาที่มุ่งเป้าไปยังโรคที่เกี่ยวข้องกับรูปแบบไกลโคซิลเลชันที่ผิดปกติ