ไอโอโดอะซิติกแอซิดถูกใช้หลักในงานวิจัยทางชีวเคมีเป็นสารอัลคิลเลติ้งเอเจนต์เพื่อปรับเปลี่ยนโปรตีนและเอนไซม์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประสิทธิภาพในการยับยั้งเอนไซม์โดยการทำปฏิกิริยากับสารตกค้าง cysteine ซึ่งมีความสำคัญต่อกิจกรรมของเอนไซม์ คุณสมบัตินี้ทำให้มีคุณค่าในการศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์และการระบุจุดสำคัญ (active sites)

นอกจากบทบาทในการยับยั้งเอนไซม์แล้ว ไอโอโดอะซิติกแอซิดยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์เพื่อปกป้องกลุ่ม thiol ระหว่างปฏิกิริยาเคมี ซึ่งช่วยให้กลุ่มฟังก์ชันเฉพาะคงสภาพเดิม ขณะที่ส่วนอื่นๆ ของโมเลกุลถูกปรับเปลี่ยน

นอกจากนี้ ไอโอโดอะซิติกแอซิดถูกใช้ในการเตรียมอนุพันธ์สำหรับวัตถุประสงค์ทางวิเคราะห์ เช่น การ derivatization ของสารประกอบสำหรับก๊าซโครมาโทกรา�ฟีหรือสเปกโตรเมตรีมวล ความสามารถในการนำอะตอมไอโอดีนเข้าไปในโมเลกุลช่วยในการตรวจจับและวิเคราะห์

ในบางกรณี ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อนำกลุ่มอะซิติกแอซิดเข้าไปในโมเลกุลเป้าหมาย ซึ่งอำนวยความสะดวกในการสร้างโครงสร้างเคมีที่ซับซ้อน