Cathepsin Inhibitor 1 ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีวเคมีเพื่อศึกษาบทบาทของเอนไซม์แคทเธปซินในกระบวนการทางเซลล์ต่างๆ โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีคุณค่าในการตรวจสอบกิจกรรมการสลายโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับโรคต่างๆ เช่น มะเร็ง ข้ออักเสบ และโรคเสื่อมถอยของระบบประสาท โดยการยับยั้งกิจกรรมของแคทเธปซิน นักวิจัยสามารถเข้าใจบทบาทของเอนไซม์ในการก้าวหน้าของเนื้องอก การแพร่กระจาย และการปรับโครงสร้างเนื้อเยื่อได้ดีขึ้น นอกจากนี้ ยังใช้เป็นเครื่องมือในการค้นพบยาเพื่อพัฒนาการบำบัดแบบกำหนดเป้าหมายที่ปรับเปลี่ยนการทำงานของแคทเธปซิน การประยุกต์ใช้ยังขยายไปถึงการศึกษาการทำงานของไลโซโซมและออโตฟาจี ซึ่งให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับกลไกการสลายเซลล์