Cruzain-IN-1 ถูกนำมาใช้ในการวิจัยและพัฒนายาต้านโรคที่เกิดจากปรสิต โดยเฉพาะโรค Chagas ซึ่งเกิดจากเชื้อ Trypanosoma cruzi ตัวยานี้มีบทบาทสำคัญในการยับยั้งเอนไซม์ cruzain ที่จำเป็นต่อการเจริญเติบโตและความอยู่รอดของปรสิต ด้วยการออกฤทธิ์เฉพาะเจาะจง Cruzain-IN-1 จึงเป็นหนึ่งในตัวเลือกที่มีศักยภาพสำหรับการพัฒนายารักษาโรค Chagas ในอนาคต นอกจากนี้ยังอาจถูกศึกษาเพิ่มเติมเพื่อประยุกต์ใช้กับโรคอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องกับเอนไซม์ protease ในลักษณะเดียวกัน