N-(Cyclopropylmethyl)cyclopropanamine ใช้ในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาสำหรับระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสร้างสารประกอบที่เล็งเป้าไปยังความผิดปกติทางระบบประสาท ใช้ในการวิจัยเพื่อออกแบบโมเลกุลที่มีศักยภาพในการเป็นยาต้านซึมเศร้าหรือยาลดความวิตกกังวล นอกจากนี้ ยังใช้ในเคมีอินทรีย์เพื่อศึกษาปฏิกิริยาของวงแหวนไซโคลโพรเพนและความเสถียรของมันในโครงสร้างที่ซับซ้อน